浙江省疾病蛋白质组学重点实验室于2009年正式立项建设，实验室依托浙江大学，以医学部病理学与病理生理学系（国家重点培育学科，卫生部临床重点专科，浙江省重点学科）、医学部生物化学和分子医学公共技术平台为主体，承担主要的建设工作。实验室主任为德国科学院院士、浙江省特级专家来茂德教授。学术委员会主任为饶子和院士。实验室总面积2600平米以上，拥有多个完整的实验室和专用公共技术平台，现有仪器设备约2200万元，已拥有进行蛋白质组学研究的大型仪器设备和辅助设备，包括BioRad全套蛋白质组分析系统（二维凝胶电泳仪、PDQuest软件、GS800扫描仪、Proteomeworks 切胶及分析系统）、GE的AKTA蛋白纯化系统及全套酶解和点样工作站，ABI的Q-Star液质联用质谱仪、Li-COR的荧光红外蛋白检测系统等大型仪器设备。另有其他基因组学和常规仪器设备，可开展目前绝大多数的研究工作。实验室研究梯队合理，拥有国家青年****2人，国家杰出青年基金1人，教育部新世纪人才2人，教授11人，副教授11人，讲师7人，专职实验技术人员11人。 浙江省疾病蛋白质组学重点实验室以立足科学发展前沿、自主创新为宗旨，以解决群众健康问题、服务社会、促进浙江省经济建设为总目标，建设一个具有浙江地方特色和国内领先、国际先进水平的疾病蛋白组学研究实验室。以重大疾病的蛋白组学研究为重点发展方向，致力于承担蛋白质研究领域的国家和浙江省关键性重大基础研究、应用研究和技术研究项目，开展蛋白质领域的原创性、前瞻性、战略性研究，产生一批具有原始创新性的成果和具有独立自主知识产权的重大科技突破，成为国内蛋白组学研究的重要基地。同时，在转化医学模式的指导和推动下，承担蛋白质组学相关生物技术产业化研究项目和国际合作项目，加快实验室研究与临床以及医药产业之间成果的转化。此项举措将大大提高我省医药科学在全国的地位，缩短与国际先进水平的差距，同时也必将战略性地带动我省的生物、医疗和制药等相关产业的发展，推动浙江省从医药大省向医药强省的转变。