生物制药技术专业是杭州市产学对接特需专业，培养的学生主要面向生物医药行业，从事药品生产、质量控制和生产管理、药品销售等工作，从事药品生产、质量控制、生产管理、药品销售等工作。岗位有：生产技术员、药物检验员（QC）、质量管理（QA）、药品销售员等。 杭州职业技术学院生物制药实训室是浙江省合格实训基地，建有生物发酵实训室、生化分离实训室、生物技术实训室、无菌操作实训室、显微操作实训室、固体制剂车间和药物制剂实训室；杭州公共实训基地药品检测中心建筑面积达到2000多平方米，首期设备总投资2500多万元。校外实训基地以华东医药为主要合作企业的紧密合作企业有20余家。