浙江省畜禽遗传育种工程技术研究中心重点研究方向为家畜和家禽遗传育种，包括畜禽遗传育种研究畜禽营养和调控技术、畜禽营养和调控技术、畜禽肉品质及质量控制、畜禽繁殖机理及控制技术和畜禽低碳饲养环境控制工程的研究等，主要是运用现代遗传学、育种学、分子生物学等学科的理论与方法，进行应用研究与基础研究，紧密联系畜禽良种选育、推广及市埸经济的发展，实行多学科协同合作，深入研究畜禽主要经济性状遗传规律及遗传环境互作效应，充分发掘畜禽遗传资源，创造出生产性能优异的优质、高产、高效畜禽新品种(系)。为提升我省和我国的畜牧业现代化水平、提高畜禽生产力及推动我省动物遗传育种学科的发展服务。 研究中心基地面积近5万平米，设有猪遗传育种、草食动物遗传育种、家禽遗传育种和动物胚胎工程学等实验室，3个直属育种场及多个科技示范推广基地。配置有种猪性能测定系统、母猪电子饲喂系统、梯度PCR仪、凝胶成像系统、大容量冷冻离心机、台式冷冻离心机、荧光倒置显微镜、显微操作仪、荧光定量PCR仪、IGLOG测膘仪、便携式pH测定仪、嫩度测定仪、膨胀仪、全自动冷冻切片机等主要仪器设备约400台套，总价值近3000万元。 本研究中心常年提供的服务项目有：畜牧场建设规划设计、畜禽品种优良品种选育及遗传评估、优质畜禽品种、畜禽基因检测、畜禽饲料配方设计、畜禽疾病监测、抗体检测、畜禽疾病诊断与治疗、畜禽肉质检测、禽产品有害类物质检测、饲料营养成分检测、饲料霉菌毒素检测等。