本实验室在农药残留领域具有近五十年的研究历史，早在上世纪60~70年代就开始农药药效和残留的研究工作。进入21世纪以来，将农药残留及应用评价研究与农产品质量安全及标准研究相结合，2001年建成“农业部农产品质量监督检验测试中心（杭州），并通过了国家计量认证和农业部机构认可，成为具有农药残留检测法定资质的机构。本实验室在农药残留领域拥有一支较强的科技人员队伍和一套较为完善的设施条件。本实验室现有44名固定人员，其中博士14人、硕士21人，正高5人、副高11人。本实验室拥有三重四级杆液质联用仪、气质联用仪等仪器设备共247台套，价值2832.9万元，其中10万元以上的大型仪器设备58套（价值3249万元）。现有实验室2953平方米，并在浙江绍兴建有农药应用评价和残留监控试验基地167亩，用于农药残留控制技术研究与示范。主要研究方向：本实验室重点开展基于化学发光、生物传感、基因组功能原理的农产品农药残留速测技术及设备研发；浊点萃取、分子印迹、免疫亲和色谱及核酸纯化等样品前处理技术及设备研发；农产品及环境中农药残留的精准和多组分检测技术研究；农药标准物质的研制；手性农药拆分和检测技术研究；农药残留检测质量控制技术研究等。研究前沿与科研成果：在农药残留领域加强科技创新，科研产出业绩显著。50多年来，曾获得国家科技进步二等奖和三等奖各1项、国家技术监督局科技进步一等奖1项、农业部技术改进一等奖和二等奖各1项及三等奖3项、浙江省科技进步二等奖4项和三等奖7项。近5年来，主持国家863项目课题、科技支撑项目课题、科技部国际合作项目、国家自然科学基金等，主持FAO农药残留风险评估项目2项、部级标准比对项目4项、省级重大和重点科技攻关项目10余项；制定国际标准2项、行业标准10项和省地方标准8项，获浙江省科学技术奖1项和国家发明专利8项，转让技术1项，已鉴定成果7项；在国内核心刊物发表论文90余篇，SCI或EI收录论文40余篇，出版专著7部。作为农业部农药登记药效、残留、环境毒理和环境行为试验单位，数十年来，每年承担农药生物测定和大田药效、残留、环境毒理和环境行为等数百项试验，为新农药成分、新剂型或在新防治作物上的登记提供科学依据，并开展新农药应用技术、药害和抗性及再猖獗机理、检测方法及环境风险评估等研究，制定相应的合理使用准则。同时，作为已通过国家实验室资质认定（计量认证）、农业部机构审查认可及农产品质量安全检测机构考核的部级质检中心，在农药残留领域的检测范围涵盖400多种农药、绝大部分的种植业产品和部分动物产品，已成为农业部“三品一标”认证和浙江省无公害农产品产地环境认定检测机构，也是浙江省进出口商品认可社会实验室，10年来承担国家和省市农产品农药残留监测任务达5万个批次以上，并对外承接认证检测和社会及科研样品的检测，为政府主管部门提供科技支撑和依托，为企业、市场、三农及消费者提供技术服务。