嘉兴水稻育种试验基地依托嘉兴市农科院而建立，于1965年开始利用海南“天然温室”的条件开展南繁育种，通过48年不间断的南繁北育，培育出包括秀水、祥湖、嘉育、嘉早、嘉湖、嘉优、嘉禾等系列的水稻品种（组合）140余个，累计推广面积达4.2亿亩，增产粮食80多亿公斤。近五年来基地育成的水稻品种继续在在浙、沪等长三角地区当家，并辐射到湖北、安徽、江西、湖南等地，年推广面积保持在800～1000万亩左右，取得了巨大的经济社会效益，同时形成了如姚海根、杨尧城、李金军等一批省内外知名专家。基地现有有国家级突出贡献专家和省突出贡献专家2名，享受国务院政府特殊津贴专家4名，省特级专家1名。基地人员牵头建立的“水稻育种创新团队”和“农作物有害生物预警与治理创新团队” 2个创新团队列入嘉兴市重点科技创新团队，并参与省科技创新团队2个。