医学分子生物学实验室始建于2004年，2009年、2010年由浙江省财政厅高校实验室建设专项资金资助续建了分子药理实验室和细胞与组织工程实验室。经过不断地改建与完善，医学分子生物学实验室通过嘉兴市科学技术局认证获“市级重点实验室”称号。 医学分子生物学实验室使用面积约500㎡，其中百级净化区域约20㎡ ，万级细胞培养实验室约50㎡。实验室现有仪器设备400多台，主要包括 流式细胞仪、荧光定量PCR仪、Olympus及Nikon显微图像分析系统、生物安全柜等，设备总价值500余万元。 医学分子生物学实验室属于科研共享平台，为全体嘉兴学院医学院师生提供科学研究硬件设施，积极进行对外服务及交流。以分子生物学实验室为依托，近五年医学院教师已经完成国家级、省部级、厅局级纵向科研课题和企事业单位委托横向科研课题143 项；医学院学生完成浙江省新苗人才计划、大学生研究训练计划（SRT）31项。 医学分子生物学实验室也同时承担一部分辅助教学示范和研究生培养任务。本实验室的各类型科研仪器，可以为部分开放性实验教学提供硬件支撑；本实验室同时也是医学院联合培养研究生的科研实验基地。