创新平台持续强化基地和团队建设，全面提升学科水平。建有国家重点实验室（共建）1个，国家地方联合工程实验室1个，农业部重点开放实验室3个，浙江省重点实验室4个，浙江省工程实验室1个。现有国家自然科学基金创新研究群体1个，教育部“长江学者和创新团队发展计划”创新团队3个，农业部“农业科研杰出人才及其创新团队”5个，浙江省重点创新团队5个，浙江省2011协同创新中心1个。 坚持“自主创新，重点跨越，支撑发展，引领未来”的指导方针，紧紧围绕国家中长期发展的战略需求，提高科研整体综合实力和核心竞争力，科研规模快速提升，科学研究持续发展。承担千万级科研项目29项，其中担任首席科学家主持“973”计划项目3项、重大科学研究计划项目1项，主持国家重点研发计划项目3项，科技支撑计划项目4项，转基因生物新品种培育重大专项11项，农业部公益性行业科研专项6项。获国家自然科学基金资助项目677项，其中国家基金委创新研究群体1项，重点项目24项，国家杰出青年科学基金9项，优秀青年科学基金7项。以第一单位获国家主要农作物品种审定2个、主要农作物品种登记4个，省级新品种审（认）定65个，植物新品种权8个，农业部农药认证1个。