莫干山研究院是由浙江工业大学与德清县人民政府共同成立的民办事业单位，总建筑面积33万方，总投资超过30亿元。研究院聚焦地理信息、生物医药、智能制造“3+X”领域，重点打造3大领域应用基础研究与科技成果转化中心，已布局有激光智能制造研究中心，莫干山碳中和创新中心，绿色化工与生物医药创新中心，地理信息创新中心，先进功能材料与装备创新中心。研究院目前已经获批省级国际科技合作基地1个，成功联合申报省制造业创新中心1个，省技术创新中心1个。成立以来，签订千万以上横向课题3项，对接服务企业90余家；建立院企联合研发中心近20家。研究院现有科研人员80余人（含柔性聘用专家），近两年共申报国家引才计划23人（火炬计划9项、海外优青8人，启明计划1人、博士后专项5项），省级引才计划15人，共引进博士、博士后14人，获批浙江工业大学专业硕士50人，已形成一支集聚顶尖高层次人才、硕博研究生的阶梯式科研队伍。