浙江省贝因美研究院于2010年批准建立，围绕为中国母婴、幼儿提供全方位服务而开展，主要职责是根据公司发展战略，制定、实施公司研发规划，建立完善研发体系，培养优秀研发人才，组织开展需求研究、技术研究和产品研究，形成自主知识产权，对研发的高效能负责，为公司可持续健康快速发展提供强有力的研发保障。根据公司的战略发展规划工作开展的需要，为加强研究院的管理，研究院建立以董事长兼任研究院院长的运作方式，以研究院执行院长为行政管理负责人，具体负责研究院的日常事物的管理。研究院根据职能不同分为三大类共13个中心，分别为：基础研究中心（包含4个中心：临床营养研究中心、母乳研究中心、母婴营养研究中心、基因营养实验室），技术研究中心（包含4个中心：工艺技术研究中心、关键技术研究中心、技术规范化研究中心、检测技术研究中心），产品研发中心（包含5个中心：配方奶粉研发中心、辅食研发中心、母婴营养品研发中心、亲子食品研发中心、儿童健康食品研发中心）。各中心以中心主任负责制开展研究工作，同时在中心内，根据所涉及专业性质的不同，设立研发经理负责制，负责本业务范围内的项目研发、技术研究及管理。