中心建成后，拥有包括微生物发酵和合成制备药物研究应用基地、优秀人才培养基地、高层次学术交流基地的三大基地，建成一个具有国际水准的的微生物发酵和合成制药工程技术研究中心；中心建成后，为国家药物微生物发酵和合成制备领域建设提供理论指导和科学依据，对前沿性和前瞻性微生物发酵和合成制备药物领域技术科学问题进行创新性研究，以促进和推动微生物发酵和合成制备药物领域技术学科的发展，研发具有自主知识产权的关键微生物发酵和合成制备药物领域处理技术和系统，以满足国家和行业部门的需求，为国家培养高水平的微生物发酵和合成制备药物领域服务专业人才。