舟山海关综合技术服务中心，是舟山海关直属事业单位。现有国家海洋生物制品检测重点实验室（舟山）、国家粮油检测重点实验室（筹）、石油及石油产品检测中心实验室、化矿产品检测实验室。主要职能是：出入境食品、动植物产品、石油、化矿及煤炭等产品的实验室检测及风险评估相关工作；海关相关领域科学技术研究、技术开发和标准制修订；破解对外贸易和公共安全的检验检疫重大技术疑难问题；承担检验检疫委托检测、鉴定、复核和仲裁；开展检验检疫技术咨询、技术培训和技术服务等。总面积约约6500平方米，拥有先进检测设备200多台套，价值4000多万元。现有工作人员30多名，其中高级职称5人、中级职称12人，博士1人、硕士11人。按照ISO/IEC 17025标准建立了完善的质量管理体系，获得中国合格评定国家认可委员会（CNAS）的认可和中国国家认证认可监督管理委员会的资质认定（计量认证）、食品检验机构资质认定。认可检测项目涵盖食品、水产品、乳制品、粮食饲料、原油、燃料油、铁矿石、煤炭、植物检疫等20大类产品162项检测能力。积极通过能力验证活动提升技术能力，近年来参加CNAS、CNCA及FAPAS等国内外能力验证活动近50次，涉及检测项目近百项，结果均为满意。2014年还首次承担了国家认监委2014年能力验证计划（B类项目）“水生动物病毒性出血性败血症病毒核酸检测”的组织工作。强化科研能力为检验检疫技术把关提供支持，近年来主持和参加了各种科研项目共计40余项其中国家科技支撑计划子课题2项，国家质检总局项目3项，科技部星火计划2项，浙江省重大科技专项6项，浙江省其他课题11项，浙江省出入境检验检疫局项目11项，并参与国家标准1项和行业标准4项。目前在Foodborne Pathog Dis、Acta Biochim Biophys Sin、微生物学报、中国人兽共患病学报、华北农学报、食品卫生等国内外期刊发表学术论文70余篇，其中SCI 10篇，国内核心期刊近60篇。共有5项发明专利及实用新型专利正在申请中，2项发明专利和7项实用新型专利已授权。