浙江省食品微生物技术研究重点实验室于2012年8月由浙江省科学技术厅批准立项建设。重点实验室以浙江工商大学为承担单位，与浙江大学和浙江省农业科学院联合共建。实验室主任为浙江工商大学食品与生物工程学院副院长顾青教授，实验室副主任为何国庆教授和王欣研究员，学术委员会主任为江南大学食品学院院长陈卫教授。 实验室以我国及浙江省食品产业发展的重大需求为导向，围绕食品微生物科学与工程应用领域的重要问题，瞄准食品微生物学科前沿，开展食品微生物基础和应用基础研究及产业化关键技术攻关。主要研究方向包括：食品微生物资源的收集和生物学基础研究；食品微生物活性物质及功能因子研究；食品微生物制造关键技术；肠道微生物生态与肠道健康。 目前，实验室承担了国家国际科技合作专项、973课题、863高新技术、国家支撑计划、国家自然科学基金、教育部博士点基金博导类项目、浙江省基金重点项目、省杰出人才基金、省重大招标课题等国家和省部级各类科技项目共30余项，年均科研经费已达800万元以上。重点实验室积极开展应用研究和科技成果转化工作，和浙江新银象生物工程有限公司、娃哈哈、新希望、美丽健等国内著名企业达成合作协议。与丹麦技术大学、荷兰Utrecht大学、柏林工业大学、德国汉堡大学、美国马歇尔大学、日本东京农工大学、加拿大农业部食品研究所、英国雷丁大学等单位有长期的技术合作与学术交流。 实验室拥有基因测序仪、DNA合成仪、大容量PCR仪、蛋白质双向电泳系统、荧光定量PCR仪、分子杂交仪、蛋白质纯化仪、酶联免疫检测仪、透射和扫描电子显微镜、倒置荧光显微镜、荧光分光光度计、等温滴定量热、分析及制备型高效液相色谱仪、质谱、液相色谱质谱联用仪、气相色谱质谱联用仪、全数字化核磁共振谱仪、全自动发酵罐等各类仪器设备。 通过整合浙江省现有食品微生物的科技与产业资源，我们将建设一个集食品微生物产业科技源头创新、成果转化与人才培养为一体的现代食品微生物产业技术创新平台。取得对我国食品微生物技术科学理论和工业应用的发展有重大推动作用的重大科技成果，成为国内一流，在国际上有一定影响的食品微生物研发中心、高级人才培养基地和成果转化中心。为我省食品微生物制造业的发展提供持续有力的科技支撑。